Národní kolo je finálovým vyvrcholením celé soutěže, na kterém se setkají nejlepší kolektivy z krajských kol. Je to týdenní akce s množstvím exkurzí a dalšího programu. Účastníkům se intenzivně věnuje celá řada odborníků v oblasti přírodovědy, ekologie a ochrany přírody.